Aumento Funzionalità Domain Controller Windows 2003 Server

[Enigmisth]

Salve a tutti,
Ho un server in azienda, Windows 2003 server, che ha ereditato la funzione di domain controller da un altro server Windows 2000 Server.
Ora, volevo ripulire un pò l'active directory e cavolate varie.. ricercando in internet sono venuto a conoscenza del comando dsquery

Purtroppo questo comando non mi funziona poichè è richiesto che io aumenti la funzionalità del domain controller.
Ho trovato queste guide:
http://technet.microsoft.com/it-it/l...=ws.10%29.aspx
http://technet.microsoft.com/it-it/l...=ws.10%29.aspx

Quello che però non spiegano è, cosa succede aumentando la funzionalità? posso incorrere in qualche problema sul dominio? devo avere determinati accorgimenti o che altro?

PS: Da notare che il server 2000 che faceva da Domain è ancora nella rete ed acceso, viene usato per alcuni programmi al suo interno e non più come Domain controller.