[help] calcolo distribuito home-made?

Lorekon · 09-10-2008, 18:13

ciao a tutti, è il mio primo post in questa sezione.

non sono un utente di boinc, seti, folding@home, sio sono, ehm...

"dall'altra parte" della barricata

cmq, io ce provo:
sono dottorando in genetica all'università di Pavia.
mi occupo di biologia molecolare
spesso mi capita di dover far girare degli applicativi di bioinformatica
capita che questi applicativi siano pesantucci
(a volte li scrivono in Java, che non è proprio un mostro di velocità)
il mio portatile con PentiumM 1 gHz e 1 Gb di Ram a volte fa parecchia fatica costringendomi a splittare i file e/o aspettare parecchio tra una botta di calcoli e l'altra.

mi domandavo se qualcuno di voi non fosse disposto, per amore della gloria e per un ringraziamento segli (eventuali) articoli pubblicati, a "prestarmi" la sua potenza di calcolo (so che avete tutti dei PC astronomici, maledetti!

).

pensavo, una volta in contatto con chi se la sente, di passarvi software, file e istruzioni e ovviamente la spiegazione di quel che si sta facendo.
la maggior parte sono per linux, qualcuno per windows.

chi se la sente?

attualmente sto usando questi
http://www.hsph.harvard.edu/~cli/complab/dchip/
http://sundarlab.ucdavis.edu/mirna/
http://acgt.cs.tau.ac.il/amadeus/index.html

gabi.2437 · 09-10-2008, 18:41

Butta su un progetto BOINC

E qua qualcuno parteciperà di sicuro

Io cmq ho windows, se vuoi passarmi qualcosa ci sono

Lorekon · 09-10-2008, 18:53

non è roba così tanto pesante

se avessi un PC più performante me lo farei da solo

se vuoi possiamo iniziare subito

hai una casella GMAIL e Java sul PC?
ti mando Amadeus e tre file (uno grossino 7 mb, gli altri piccoli).

daiiiiiiiiiiiiiiiii

gabi.2437 · 09-10-2008, 19:01

Niente gmail, e java boh, avevo installato una volta una roba... non puoi uppare i file su qualcosa tipo rapidshare?

SwOrDoFmYdEsTiNy · 09-10-2008, 19:15

io posso fare quelli su linux senza problemi

P.s. siccome sono abba strodito, se mi rispondi, fallo x pm (XD)

banana snapple · 09-10-2008, 20:26

se non è una cosa troppo difficile da fare, passa pure qualcosa per windows

EDIT: contattami in pvt su come fare, se vuoi ti passo anche la mail di gmail se ti fa più comodo!

gabi.2437 · 09-10-2008, 20:30

Fai un zip, uppa su rapidshare e bon, al max dici chi deve elaborare cosa

SwOrDoFmYdEsTiNy · 09-10-2008, 20:44

Quote:

Originariamente inviato da gabi.2437

Fai un zip, uppa su rapidshare e bon, al max dici chi deve elaborare cosa

ma sopratutto come fare

P.s. io ho ubuntu, non so a quale distro linux ti riferisci, però penso che vada bene lo stesso ^^

Lorekon · 10-10-2008, 12:03

grazie a tutti

adesso metto in ordine di priorità le cose da fare poi mi faccio vivo

Lorekon · 10-10-2008, 16:28

ok ci siamo

chi ha 2 Gb di ram e Java su windows?

banana snapple · 10-10-2008, 17:00

Quote:

Originariamente inviato da Lorekon

ok ci siamo

chi ha 2 Gb di ram e Java su windows?

sui 2 gb di ram ci sono

per il java anche credo di si, tengo installato Java(TM) 6 Update 7

Lorekon · 10-10-2008, 17:03

tutto perfetto!

ok
mandami in pvt una casella GMAIL che ti mando tutto (i file di 7 mb dell'applicativo JAva, un file di 7 mb da dargli in pasto, più altre cosettine piccole e le istruzioni).
ti linko anche la pagina del programmino, magari ti interessa sapere cosa stiamo calcolando

poi scappo che devo annà

Lorekon · 10-10-2008, 18:02

banana snapple ti sto mandando un file con dentro tutto ma anche zippato risulta di 42 mb!!!
adesso lo sto uploadando su rapidshare.

però mò stacco, se riesco mi colelgo nel weekend, sennò ci sentiamo lunedì

peccato perchè mi sarebbe piaciuto fare tutti in "presa diretta"

banana snapple · 10-10-2008, 18:04

Quote:

Originariamente inviato da Lorekon

banana snapple ti sto mandando un file con dentro tutto ma anche zippato risulta di 42 mb!!!
adesso lo sto uploadando su rapidshare.

però mò stacco, se riesco mi colelgo nel weekend, sennò ci sentiamo lunedì

peccato perchè mi sarebbe piaciuto fare tutti in "presa diretta"

ok! non ti preoccupare fa con comodo!

Lorekon · 10-10-2008, 18:06

mentre parte la mail, dovrebbe arrivarti in mail il link di rapidshare.

provi a controllare se è arrivato?

EDIT a me è arrivato, prova un pò a scaricare

banana snapple · 10-10-2008, 18:09

arrivato! file in download

Lorekon · 10-10-2008, 18:15

nooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo la mail!!!

mi si è cancellata, ci avevo messo un quarto d'ora a mettere dentro le istruzioni

devo proprio scappare, divertiti se hei tempo e voglia, ci sentiamo lunedì

ciaoooooooo e grazie

banana snapple · 10-10-2008, 18:18

ok!

vedo che combino da solo, al limite aspetto le istruzioni!

SwOrDoFmYdEsTiNy · 10-10-2008, 20:57

se serve una mano anche io ho 2 gb di ram su windows (XP) e java, dovrebbe esserci già

P.s. io sono disponibile per fare anche le cose su Ubuntu (linux)

Lorekon · 13-10-2008, 11:52

Quote:

Originariamente inviato da SwOrDoFmYdEsTiNy

se serve una mano anche io ho 2 gb di ram su windows (XP) e java, dovrebbe esserci già

P.s. io sono disponibile per fare anche le cose su Ubuntu (linux)

ciao

semi dai una casella di posta ti scrivo link istruzioni e tutto

grazie anche a te

09-10-2008, 18:13	#1
Lorekon Senior Member Iscritto dal: May 2002 Città: Pavia.. a volte Milano o Como...talora Buccinasco! Firenze fino al 15/7 Messaggi: 2143	[help] calcolo distribuito home-made? ciao a tutti, è il mio primo post in questa sezione. non sono un utente di boinc, seti, folding@home, sio sono, ehm... "dall'altra parte" della barricata cmq, io ce provo: sono dottorando in genetica all'università di Pavia. mi occupo di biologia molecolare spesso mi capita di dover far girare degli applicativi di bioinformatica capita che questi applicativi siano pesantucci (a volte li scrivono in Java, che non è proprio un mostro di velocità) il mio portatile con PentiumM 1 gHz e 1 Gb di Ram a volte fa parecchia fatica costringendomi a splittare i file e/o aspettare parecchio tra una botta di calcoli e l'altra. mi domandavo se qualcuno di voi non fosse disposto, per amore della gloria e per un ringraziamento segli (eventuali) articoli pubblicati, a "prestarmi" la sua potenza di calcolo (so che avete tutti dei PC astronomici, maledetti! ). pensavo, una volta in contatto con chi se la sente, di passarvi software, file e istruzioni e ovviamente la spiegazione di quel che si sta facendo. la maggior parte sono per linux, qualcuno per windows. chi se la sente? attualmente sto usando questi http://www.hsph.harvard.edu/~cli/complab/dchip/ http://sundarlab.ucdavis.edu/mirna/ http://acgt.cs.tau.ac.il/amadeus/index.html __________________ "Le masse sono abbagliate più facilmente da una grande bugia che da una piccola". (Adolf Hitler) "Se sei bello ti tirano le pietre, se sei brutto ti tirano le pietre. se sei al duomo ti tirano il duomo". (cit. un mio amico )

09-10-2008, 18:41	#2
gabi.2437 Senior Member Iscritto dal: Sep 2006 Messaggi: 7030	Butta su un progetto BOINC E qua qualcuno parteciperà di sicuro Io cmq ho windows, se vuoi passarmi qualcosa ci sono __________________

09-10-2008, 18:53	#3
Lorekon Senior Member Iscritto dal: May 2002 Città: Pavia.. a volte Milano o Como...talora Buccinasco! Firenze fino al 15/7 Messaggi: 2143	non è roba così tanto pesante se avessi un PC più performante me lo farei da solo se vuoi possiamo iniziare subito hai una casella GMAIL e Java sul PC? ti mando Amadeus e tre file (uno grossino 7 mb, gli altri piccoli). daiiiiiiiiiiiiiiiii __________________ "Le masse sono abbagliate più facilmente da una grande bugia che da una piccola". (Adolf Hitler) "Se sei bello ti tirano le pietre, se sei brutto ti tirano le pietre. se sei al duomo ti tirano il duomo". (cit. un mio amico )

09-10-2008, 19:01	#4
gabi.2437 Senior Member Iscritto dal: Sep 2006 Messaggi: 7030	Niente gmail, e java boh, avevo installato una volta una roba... non puoi uppare i file su qualcosa tipo rapidshare? __________________

09-10-2008, 20:26	#6
banana snapple Senior Member Iscritto dal: Mar 2007 Città: cazzi tuoi se poi mi trovi F1: attento tifo McLaren! Pericolo: ... dicono che se mi beccano mi tagliano la cresta.. Stato: he was a boy, she was a girl... can I make it anymore obvious? Messaggi: 755	se non è una cosa troppo difficile da fare, passa pure qualcosa per windows EDIT: contattami in pvt su come fare, se vuoi ti passo anche la mail di gmail se ti fa più comodo! __________________ Buona notte... eh, qui è Radio Raptus e io sono Benassi... Ivan. Forse lì c’è qualcuno che non dorme... beh comunque che ci siate o no io ci ho una cosa da dire. Oggi ho avuto una discussione con un mio amico. Lui... beh lui è uno di quelli bravi... bravi a credere in quello in cui gli dicono di credere. Lui, lui dice che se uno non crede in certe cose non crede in niente... beh non è vero. Anch’io credo. Ultima modifica di banana snapple : 09-10-2008 alle 20:54.

09-10-2008, 19:15	#5
SwOrDoFmYdEsTiNy Senior Member Iscritto dal: Apr 2008 Città: Cernusco Sul Naviglio (MI) Messaggi: 1292	io posso fare quelli su linux senza problemi P.s. siccome sono abba strodito, se mi rispondi, fallo x pm (XD)

09-10-2008, 20:30	#7
gabi.2437 Senior Member Iscritto dal: Sep 2006 Messaggi: 7030	Fai un zip, uppa su rapidshare e bon, al max dici chi deve elaborare cosa __________________

10-10-2008, 12:03	#9
Lorekon Senior Member Iscritto dal: May 2002 Città: Pavia.. a volte Milano o Como...talora Buccinasco! Firenze fino al 15/7 Messaggi: 2143	grazie a tutti adesso metto in ordine di priorità le cose da fare poi mi faccio vivo __________________ "Le masse sono abbagliate più facilmente da una grande bugia che da una piccola". (Adolf Hitler) "Se sei bello ti tirano le pietre, se sei brutto ti tirano le pietre. se sei al duomo ti tirano il duomo". (cit. un mio amico )

10-10-2008, 16:28	#10
Lorekon Senior Member Iscritto dal: May 2002 Città: Pavia.. a volte Milano o Como...talora Buccinasco! Firenze fino al 15/7 Messaggi: 2143	ok ci siamo chi ha 2 Gb di ram e Java su windows? __________________ "Le masse sono abbagliate più facilmente da una grande bugia che da una piccola". (Adolf Hitler) "Se sei bello ti tirano le pietre, se sei brutto ti tirano le pietre. se sei al duomo ti tirano il duomo". (cit. un mio amico )

10-10-2008, 17:03	#12
Lorekon Senior Member Iscritto dal: May 2002 Città: Pavia.. a volte Milano o Como...talora Buccinasco! Firenze fino al 15/7 Messaggi: 2143	tutto perfetto! ok mandami in pvt una casella GMAIL che ti mando tutto (i file di 7 mb dell'applicativo JAva, un file di 7 mb da dargli in pasto, più altre cosettine piccole e le istruzioni). ti linko anche la pagina del programmino, magari ti interessa sapere cosa stiamo calcolando poi scappo che devo annà __________________ "Le masse sono abbagliate più facilmente da una grande bugia che da una piccola". (Adolf Hitler) "Se sei bello ti tirano le pietre, se sei brutto ti tirano le pietre. se sei al duomo ti tirano il duomo". (cit. un mio amico )

10-10-2008, 18:02	#13
Lorekon Senior Member Iscritto dal: May 2002 Città: Pavia.. a volte Milano o Como...talora Buccinasco! Firenze fino al 15/7 Messaggi: 2143	banana snapple ti sto mandando un file con dentro tutto ma anche zippato risulta di 42 mb!!! adesso lo sto uploadando su rapidshare. però mò stacco, se riesco mi colelgo nel weekend, sennò ci sentiamo lunedì peccato perchè mi sarebbe piaciuto fare tutti in "presa diretta" __________________ "Le masse sono abbagliate più facilmente da una grande bugia che da una piccola". (Adolf Hitler) "Se sei bello ti tirano le pietre, se sei brutto ti tirano le pietre. se sei al duomo ti tirano il duomo". (cit. un mio amico )

10-10-2008, 18:06	#15
Lorekon Senior Member Iscritto dal: May 2002 Città: Pavia.. a volte Milano o Como...talora Buccinasco! Firenze fino al 15/7 Messaggi: 2143	mentre parte la mail, dovrebbe arrivarti in mail il link di rapidshare. provi a controllare se è arrivato? EDIT a me è arrivato, prova un pò a scaricare __________________ "Le masse sono abbagliate più facilmente da una grande bugia che da una piccola". (Adolf Hitler) "Se sei bello ti tirano le pietre, se sei brutto ti tirano le pietre. se sei al duomo ti tirano il duomo". (cit. un mio amico )

10-10-2008, 18:09	#16
banana snapple Senior Member Iscritto dal: Mar 2007 Città: cazzi tuoi se poi mi trovi F1: attento tifo McLaren! Pericolo: ... dicono che se mi beccano mi tagliano la cresta.. Stato: he was a boy, she was a girl... can I make it anymore obvious? Messaggi: 755	arrivato! file in download __________________ Buona notte... eh, qui è Radio Raptus e io sono Benassi... Ivan. Forse lì c’è qualcuno che non dorme... beh comunque che ci siate o no io ci ho una cosa da dire. Oggi ho avuto una discussione con un mio amico. Lui... beh lui è uno di quelli bravi... bravi a credere in quello in cui gli dicono di credere. Lui, lui dice che se uno non crede in certe cose non crede in niente... beh non è vero. Anch’io credo.

10-10-2008, 18:15	#17
Lorekon Senior Member Iscritto dal: May 2002 Città: Pavia.. a volte Milano o Como...talora Buccinasco! Firenze fino al 15/7 Messaggi: 2143	nooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo la mail!!! mi si è cancellata, ci avevo messo un quarto d'ora a mettere dentro le istruzioni devo proprio scappare, divertiti se hei tempo e voglia, ci sentiamo lunedì ciaoooooooo e grazie __________________ "Le masse sono abbagliate più facilmente da una grande bugia che da una piccola". (Adolf Hitler) "Se sei bello ti tirano le pietre, se sei brutto ti tirano le pietre. se sei al duomo ti tirano il duomo". (cit. un mio amico )

10-10-2008, 18:18	#18
banana snapple Senior Member Iscritto dal: Mar 2007 Città: cazzi tuoi se poi mi trovi F1: attento tifo McLaren! Pericolo: ... dicono che se mi beccano mi tagliano la cresta.. Stato: he was a boy, she was a girl... can I make it anymore obvious? Messaggi: 755	ok! vedo che combino da solo, al limite aspetto le istruzioni! __________________ Buona notte... eh, qui è Radio Raptus e io sono Benassi... Ivan. Forse lì c’è qualcuno che non dorme... beh comunque che ci siate o no io ci ho una cosa da dire. Oggi ho avuto una discussione con un mio amico. Lui... beh lui è uno di quelli bravi... bravi a credere in quello in cui gli dicono di credere. Lui, lui dice che se uno non crede in certe cose non crede in niente... beh non è vero. Anch’io credo.

10-10-2008, 20:57	#19
SwOrDoFmYdEsTiNy Senior Member Iscritto dal: Apr 2008 Città: Cernusco Sul Naviglio (MI) Messaggi: 1292	se serve una mano anche io ho 2 gb di ram su windows (XP) e java, dovrebbe esserci già P.s. io sono disponibile per fare anche le cose su Ubuntu (linux)

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