Audio non sincronizzato con Gordian knot

[Bender2010]

Ho gia fatto moltissimi divx con Gordian knot
Per molti nessun problema di sincronizzazione audio ma per alcuni non viene sincronizzato.
All'inizio del video tutto a posto poi sfasa andando avanti.

Mi sono accorto che la traccia audio estratta e convertita in automatico da Gordian Knot ha una durata diversa dal video
in alcuni di un minuto in un altro addirittura di 4 0 5 minuti.
Quale potrebbe essere il motivo?

Facendo diverse prove con l'interleaving con nundub non riesco a sincronizzarlo

Il file video iniziale e' un Mpg2 registrato con dvd recorder dalla tv,
Publicita' eliminata attraverso il dvd recorder nascondendo i capitoli (potrebbe essere questa la causa?)