[Java] JEE con NetBeans 6.8

[Zoddicus]

Salve a tutti, la mia domanda è la seguente: come viene gestito l'avvio di un "Web project" in NetBeans? Spiego la mia situazione in modo tale da fornire un quadro più specifico. Ho iniziato a provare qualche esempio relativamente a JPA, quindi l'esempio in questione consta di:
1) una jsp che possiede solo la scritta "DB creato" ;
2)una servlet con l'annotazione della PersistenceUnit e l'EntityManager;
3)due Entity.
il tutto funziona.
Gli esempi precedenti da me provati erano più semplici e "lineari" per me, parte una jsp che con un bottone chiama la servlet ma qui mi rendo conto che è diverso.
Il problema è che non ho capito come si lega il run del progetto a quello che credo sia l'avvio reale, ho provato a cercare nel file build-impl.xml, sono presenti delle voci relative al run ma non ci ho capito granchè( sono script Ant giusto?..dalla mia domanda si dovrebbe capire che ignoro completamente Ant ) e soprattutto non sono sicuro che la mia intuizione sia corretta .
grazie a tutti le risposte