Problemi con il boot

[massi1977]

Ciao a tutti,
è da qualche giorno che inspiegabilmente il mio pc ha problemi durante il boot, vi spiego:
Accendo il PC fa il checking della memeoria e poi passa al controllo delle periferiche, trova i 2 masterizzatori e poi alcune volte invece di trovarmi i 3 HD collegati me ne rileva solo 1 (che tra cui non è manco quello che mi serve per avviare Windows). Ho già provato a resettare il bios sia tramite jumper, sia tramite il caricamento delle impostazioni predefinite che rifacendo il flashing dello stesso. Non cambia nulla.
In aggiunta, quando il boot lo fa correttamente, se vado nella Gestione Disco di Windows mi ritrovo i dischi in ordine errato, nel mio caso mi trovo
la Partizione C: che dovrebbe essere il Disco 1 come Disco 2,
la partizione D: che dovrebbe essere il Disco 2 come Disco 3
la partizione E: che dovrebbe essere il Disco 3 come Disco 1
In sostanza con Win già installato non mi cambia nulla, ma se devo reinstallare è un casino se mi vede le partizioni sbagliate, in quanto mi trovo magari l'installazione su D: o su E:
Però anche in questo caso, l'ordine errato avviene in maniera random, la colpa non è di Windows, perchè ho provato con Ubuntu su CD e pure lui a random mi rileva i dischi in ordine diverso.
Ho già provato a scollegare e ricollegare le periferiche, scambiargli le posizioni del S-ATA, lasciar scollegato 1 HD, scollegare il master. S-ATA o quello ATA, ma non cambia nulla.

Il mio PC è così:
MB: Asrock Alive Sata2 GLAN
CPU: ADM Athlon 64 X2 4200+
Ram: 2 moduli da 1GB, Corsair XMS2
Alimentatore: 600W
Masterizzatori: 1 ATA e 1 S-ATA
HD: 3 S-ATA2
Scheda Video: Ati Radeon HD 3450
Scheda Audio e di Rete Onboard
Controller S-ATA2 impostato in modalità IDE non RAID.

Mi sapreste spiegare il motivo di questi problemi e consigliarmi un modo di risolvere.