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Old 25-09-2007, 12:54   #1
HDisperate
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Estenuante installazione su linux!

Allora, è circa una settimana che provo ad installare un programma, scaricato da FSF, su Ubuntu. I primi 4 giorni li ho passati a soddisfare le dipendenze, poi 2 giorni per capire cosa non andasse visto che si bloccava (altra dipendenza a quanto pare) infine sono 2 giorni che ottengo sempre lo stesso messaggio.
Il programma è "ecell"(E' di biologia cellulare/molecolare, non ho scritto male excell ) e, dopo aver soddisfatto 3000 dipendenze arrivo ad un punto in cui ottengo "syntax error near unexpected token `('"; per completezza vi incollo le ultime righe del terminale:
...
checking math usability... no
checking math presence... no
checking for math... no
checking cmath usability... yes
checking cmath presence... yes
checking for cmath... yes
checking for dmtool dir... /home/antonio/Desktop/ecell-3.1.105
checking for headers required to compile python extensions... ./configure: line 21611: syntax error near unexpected token `('
./configure: line 21611: `case "(($ac_try" in'
configure: error: ./configure failed for ecell

Qualcuno sa di che si tratta e come poter ovviare? Sarebbe già il terzo programma al quale rinuncio per indisposizione del sistema operativo
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Old 25-09-2007, 13:01   #2
xyz3D
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L'Avatar di xyz3D
 
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Messaggi: 277
Il problema non è il sistema operativo.

Il problema è che ti mancano credo dei moduli in Python (forse python-dev) e non puoi compilare il programma (che non conosco).
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Old 25-09-2007, 13:08   #3
HDisperate
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Messaggi: 80
ho installato python-dev, ma nulla... ancora lo stesso errore
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Old 25-09-2007, 13:13   #4
ilsensine
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L'Avatar di ilsensine
 
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Messaggi: 15625
Puoi allegare il file config.log?
__________________
0: or %edi, %ecx; adc %eax, (%edx); popf; je 0b-22; pop %ebx; fadds 0x56(%ecx); lds 0x56(%ebx), %esp; mov %al, %al
andeqs pc, r1, #147456; blpl 0xff8dd280; ldrgtb r4, [r6, #-472]; addgt r5, r8, r3, ror #12
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Old 25-09-2007, 13:19   #5
HDisperate
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Iscritto dal: Sep 2007
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Eccolo
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Old 25-09-2007, 13:23   #6
ilsensine
Senior Member
 
L'Avatar di ilsensine
 
Iscritto dal: Apr 2000
Città: Roma
Messaggi: 15625
Il file fantasma...

(hint: comprimilo con gzip)
__________________
0: or %edi, %ecx; adc %eax, (%edx); popf; je 0b-22; pop %ebx; fadds 0x56(%ecx); lds 0x56(%ebx), %esp; mov %al, %al
andeqs pc, r1, #147456; blpl 0xff8dd280; ldrgtb r4, [r6, #-472]; addgt r5, r8, r3, ror #12
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Old 25-09-2007, 13:24   #7
HDisperate
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Iscritto dal: Sep 2007
Messaggi: 80
Quote:
Originariamente inviato da HDisperate Guarda i messaggi
Eccolo
No, a quanto pare è troppo pesante
lo spezzo in 2 parti
Qui c'è il primo
Allegati
File Type: txt Config1.txt (17.3 KB, 4 visite)
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Old 25-09-2007, 13:25   #8
HDisperate
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Iscritto dal: Sep 2007
Messaggi: 80
E qui il secondo
Si, hai ragione, non ho pensato a comprimerlo :P
Allegati
File Type: txt Config2.txt (12.0 KB, 5 visite)
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Old 25-09-2007, 13:31   #9
zephyr83
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L'Avatar di zephyr83
 
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Messaggi: 12682
qualcuno si domanda ancora a cosa servono i PBI (o simili)? in casi come questo sn d'oblbigo a mio avviso!!
__________________
"Non capisco quelli che dicono che per avere successo devono soffrire. Ma che so', scemi?"
Intel Core 2 Quad Q9450 @ 2.66 Ghz, Asus P5K-VM, Ram 4 GB A-Data + 2 GB Kingmax 800 Mhz, Gigabyte GeForce GT 710 2 GB GDDR5 passiva (GV-N710D5SL-2GL), SSD Crucial BX500 CT120BX500SSD1 120 GB, Monitor LCD Samsung S22C300 21.5'', router D-Link DVA-5592
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Old 25-09-2007, 13:38   #10
ilsensine
Senior Member
 
L'Avatar di ilsensine
 
Iscritto dal: Apr 2000
Città: Roma
Messaggi: 15625
Da quello che leggo dovrebbe esserci un altro config.log dentro la sottodirectory ecell. Puoi controllare?
__________________
0: or %edi, %ecx; adc %eax, (%edx); popf; je 0b-22; pop %ebx; fadds 0x56(%ecx); lds 0x56(%ebx), %esp; mov %al, %al
andeqs pc, r1, #147456; blpl 0xff8dd280; ldrgtb r4, [r6, #-472]; addgt r5, r8, r3, ror #12
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Old 25-09-2007, 13:53   #11
HDisperate
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Iscritto dal: Sep 2007
Messaggi: 80
io ne vedo uno solo :S
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Old 25-09-2007, 13:57   #12
Fil9998
Senior Member
 
L'Avatar di Fil9998
 
Iscritto dal: Sep 2004
Città: Padova
Messaggi: 11777
Quote:
Originariamente inviato da zephyr83 Guarda i messaggi
qualcuno si domanda ancora a cosa servono i PBI (o simili)? in casi come questo sn d'oblbigo a mio avviso!!
mi sa che siamo giusto in due a pensarla così.
__________________
mac user = hai soldi da buttare; linux user = hai tempo da buttare; windows user = hai soldi e tempo da buttare
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Old 25-09-2007, 13:59   #13
ilsensine
Senior Member
 
L'Avatar di ilsensine
 
Iscritto dal: Apr 2000
Città: Roma
Messaggi: 15625
Dal secondo file che hai allegato:
Codice:
configure:20685: === configuring in libltdl (/home/antonio/Desktop/ecell-3.1.105/libltdl)
configure:20788: running /bin/bash ./configure '--prefix=/usr/local'  '--enable-ltdl-convenience' --cache-file=/dev/null --srcdir=.
configure:20685: === configuring in dmtool (/home/antonio/Desktop/ecell-3.1.105/dmtool)
configure:20788: running /bin/bash ./configure '--prefix=/usr/local'  '--enable-ltdl-convenience' --cache-file=/dev/null --srcdir=.
configure:20685: === configuring in ecell (/home/antonio/Desktop/ecell-3.1.105/ecell)
configure:20788: running /bin/bash ./configure '--prefix=/usr/local'  '--enable-ltdl-convenience' --cache-file=/dev/null --srcdir=.
configure:20793: error: ./configure failed for ecell
sembrerebbe entrare nelle sottodirectory indicate (libltdl, dmtool, ecell) ed eseguire unteriori configure da lì...
__________________
0: or %edi, %ecx; adc %eax, (%edx); popf; je 0b-22; pop %ebx; fadds 0x56(%ecx); lds 0x56(%ebx), %esp; mov %al, %al
andeqs pc, r1, #147456; blpl 0xff8dd280; ldrgtb r4, [r6, #-472]; addgt r5, r8, r3, ror #12
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Old 25-09-2007, 14:10   #14
HDisperate
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Messaggi: 80
si hai ragione, li allego qua!
Allegati
File Type: gz config(Dalla cartella ecell).log.gz (8.2 KB, 2 visite)
File Type: gz config(Da cartella libltdl).log.gz (7.2 KB, 0 visite)
File Type: gz config(Da cartella dmtool).log.gz (5.7 KB, 0 visite)
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Old 25-09-2007, 14:19   #15
ilsensine
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L'Avatar di ilsensine
 
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Città: Roma
Messaggi: 15625
Il log è sano, c'è proprio un errore di sintassi in configure.
Mi scarico il pacchetto e do una occhiata...
__________________
0: or %edi, %ecx; adc %eax, (%edx); popf; je 0b-22; pop %ebx; fadds 0x56(%ecx); lds 0x56(%ebx), %esp; mov %al, %al
andeqs pc, r1, #147456; blpl 0xff8dd280; ldrgtb r4, [r6, #-472]; addgt r5, r8, r3, ror #12
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Old 25-09-2007, 14:25   #16
HDisperate
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Messaggi: 80
Ok, thx!
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Old 25-09-2007, 14:27   #17
ilsensine
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L'Avatar di ilsensine
 
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Città: Roma
Messaggi: 15625
non mi si apre il sito
Tu da dove hai scaricato?
__________________
0: or %edi, %ecx; adc %eax, (%edx); popf; je 0b-22; pop %ebx; fadds 0x56(%ecx); lds 0x56(%ebx), %esp; mov %al, %al
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Old 25-09-2007, 16:33   #18
HDisperate
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Iscritto dal: Sep 2007
Messaggi: 80
http://directory.fsf.org/science/biology/

Si chiama E-Cell Simulation Environment
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Old 25-09-2007, 16:59   #19
ilsensine
Senior Member
 
L'Avatar di ilsensine
 
Iscritto dal: Apr 2000
Città: Roma
Messaggi: 15625
...sulla mia Etch il configure va a buon fine

L'unica differenza è che seguendo il tuo link mi sono ritrovato la ver. 3.1.103 invece della 3.1.105. Non credo che faccia differenza.

e, per la cronaca, occorre modificare i sorgenti per compilarlo con il gcc 4.x.
Fatto questo, si blocca nella compilazione più avanti

Quel programma non sembra più mantenuto.
__________________
0: or %edi, %ecx; adc %eax, (%edx); popf; je 0b-22; pop %ebx; fadds 0x56(%ecx); lds 0x56(%ebx), %esp; mov %al, %al
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Old 25-09-2007, 17:05   #20
HDisperate
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Iscritto dal: Sep 2007
Messaggi: 80
Tu che versione hai installato quindi? la 3.1.103?
Che vuol dire che non è mantenuto?

Beh, io non mi sono mai addentrato nella programmazione e quindi per me è un pò difficile immedesimarmi, già il fatto che un programma vada compilato e poi installato mi lascia perplesso:P

Tra l'altronon so mai come associare errori a problemi: finchè sono dipendenze ok! ma adesso per esempio, per un altro programma sto avendo quest'errore:
main.c: At top level:
main.c:5965: error: expected ‘)’ before ‘*’ token
main.c:5995: error: expected ‘)’ before ‘*’ token
make: *** [main.o] Error 1
Altro errore di sintassi?! Inutile dire che questi sono frequentissimi e fin'ora sono stati frequentissiimi i miei fallimenti nell'installazione. Non mi piacerebbe arrivare ad usare linux solo per quei 4 programmi a "papa pronta", vorrei usarlo quasi al pari di Windows

Ultima modifica di HDisperate : 25-09-2007 alle 17:16.
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