[C o Fortran]Creare dei files modificando un input

[Lucrezio]

Ciao a tutti!
Sono assolutamente a livello zero in programmazione ed avrei bisogno di scrivere uno script che mi aiutasse a preparare degli input per calcolo scientifico.
In particolare io ho un dimero composto da due molecole e voglio fare dei calcoli mettendo queste due molecole (che stanno su piani paralleli) a varie distanze interplanari e facendole scorrere l'una sull'altra.
In pratica se entrambe si trovano su un piano parallelo ad xy lo script dovrebbe andare a generare, a partire da un input iniziale, dei files in cui vengono cambiate le cordinate di uno dei due pezzi aumentando, ad esempio la z di un certo passo per un certo numero di volte; al contempo per ogni passo dovrebbe invece aumentare un'altra cordinata (es: la x) in modo da far slittare le molecole l'una sull'altra.
Qui c'è un esempio di input:

%chk=perileneFTF.chk
%mem=70MW
%nproc=1
#p opt hf/6-31+g(d,p)

opt perilene FTF

0 1
 C                  0.00000000    0.00000000    0.00000000
 C                  0.00000000    0.00000000    1.40140000
 C                  1.21364800    0.00000000    2.10210000
 C                  2.42729600    0.00000000    1.40140000
 C                  2.42729600    0.00000000    0.00000000
 C                  1.21364800    0.00000000   -0.70070000
 H                  0.28700100    0.00000000    4.03850000
 H                 -0.92664700    0.00000000   -0.53500000
 H                 -0.92664700    0.00000000    1.93640000
 C                  1.21364800    0.00000000    3.50350000
 C                  3.64094400    0.00000000    2.10210000
 H                  1.21364800    0.00000000   -1.77070000
 C                  3.64094400    0.00000000    3.50350000
 C                  2.42729600    0.00000000    4.20420000
 H                  4.56759100    0.00000000    4.03850000
 H                  2.42729600    0.00000000    5.27420000
 C                  3.76097500    0.00000000   -0.77000000
 C                  3.76097500    0.00000000   -2.17140000
 C                  4.97462300    0.00000000   -0.06930000
 C                  4.97462300    0.00000000   -2.87210000
 H                  2.83432800    0.00000000   -2.70640000
 C                  6.18827100    0.00000000   -0.77000000
 C                  4.97462300    0.00000000    1.33210000
 C                  6.18827100    0.00000000   -2.17140000
 H                  4.97462300    0.00000000   -3.94210000
 C                  7.40191900    0.00000000   -0.06930000
 C                  6.18827100    0.00000000    2.03280000
 H                  7.11491800    0.00000000   -2.70640000
 C                  7.40191900    0.00000000    1.33210000
 H                  8.32856600    0.00000000   -0.60430000
 H                  6.18827100    0.00000000    3.10280000
 H                  8.32856600    0.00000000    1.86710000
 C                  0.00000000    4.00000000    0.00000000
 C                  0.00000000    4.00000000    1.40140000
 C                  1.21364800    4.00000000    2.10210000
 C                  2.42729600    4.00000000    1.40140000
 C                  2.42729600    4.00000000    0.00000000
 C                  1.21364800    4.00000000   -0.70070000
 H                  0.28700100    4.00000000    4.03850000
 H                 -0.92664700    4.00000000   -0.53500000
 H                 -0.92664700    4.00000000    1.93640000
 C                  1.21364800    4.00000000    3.50350000
 C                  3.64094400    4.00000000    2.10210000
 H                  1.21364800    4.00000000   -1.77070000
 C                  3.64094400    4.00000000    3.50350000
 C                  2.42729600    4.00000000    4.20420000
 H                  4.56759100    4.00000000    4.03850000
 H                  2.42729600    4.00000000    5.27420000
 C                  3.76097500    4.00000000   -0.77000000
 C                  3.76097500    4.00000000   -2.17140000
 C                  4.97462300    4.00000000   -0.06930000
 C                  4.97462300    4.00000000   -2.87210000
 H                  2.83432800    4.00000000   -2.70640000
 C                  6.18827100    4.00000000   -0.77000000
 C                  4.97462300    4.00000000    1.33210000
 C                  6.18827100    4.00000000   -2.17140000
 H                  4.97462300    4.00000000   -3.94210000
 C                  7.40191900    4.00000000   -0.06930000
 C                  6.18827100    4.00000000    2.03280000
 H                  7.11491800    4.00000000   -2.70640000
 C                  7.40191900    4.00000000    1.33210000
 H                  8.32856600    4.00000000   -0.60430000
 H                  6.18827100    4.00000000    3.10280000
 H                  8.32856600    4.00000000    1.86710000

Le tre colonne di numeri sono, appunto, le x, le y e le z. In questo caso i due monomeri si trovano su un piano parallelo ad xz ad una distanza interplanare di 4 A e sono perfettamente affacciate.
Grazie a tutti in anticipo

[Lucrezio]

uppettino...