Boinc su linux

[Dominus]

Salve a tutti.. finalmente comincio a scaccolare anche io eheheh.. a casa ho sia win che linux.. ma l'ho installato su win perchè ho più memoria su HD e quindi posso utilizzare anche emule ecc ecc... dove lavoro ho debian ubuntu.. l'ho installato(la verisone atuale non è disponibile nel sito) e ho messo la versione 5.4.9 ma non va la grafica.. nel senso.. non mi fa vedere la grafica di avanzamento dei progetti...il programma si visualizza perfettamente ma i modelli grafici no. ora.. qui mi va anche bene tanto deve restare in background.. ma a casa ci tengo a vedere la grafica... chi di voi lo usa su linux?? vi funziona tutto bene?????? Se decidessi di metterlo su lin anche a casa.. non vedrei la pagina grafica.. p.s ( qui al lavoro ne elabora uno alla volta mentre a casa 2 alla volta come mai?) grazie.

[Dominus]

Azz però... a casa con un intel 3.0 Ghz una caccola di roseta la fa in 1 ora.. qui al lavoro con un intel a 2.80 Ghz (quasi) .. ci mette 8 ore.. anche con sistema operativo diverso.. a casa win e qui al lavoro linux.

[wubby]

Originariamente inviato da Dominus

dove lavoro ho debian ubuntu.. l'ho installato(la verisone atuale non è disponibile nel sito)

Tanto per chiarire...

dpkg -l | grep boinc

e ho messo la versione 5.4.9 ma non va la grafica.. nel senso.. non mi fa vedere la grafica di avanzamento dei progetti...

Il boinc manager che uso su debian

ii  boinc-manager                   5.4.11-4

mi visualizza correttamente i grafici di Seti.

il programma si visualizza perfettamente ma i modelli grafici no. ora.. qui mi va anche bene tanto deve restare in background.. ma a casa ci tengo a vedere la grafica...

Ehe...
pero' ti porta via un mucchio di risorse...

chi di voi lo usa su linux?? vi funziona tutto bene?????? Se decidessi di metterlo su lin anche a casa.. non vedrei la pagina grafica.. p.s ( qui al lavoro ne elabora uno alla volta mentre a casa 2 alla volta come mai?) grazie.

Che processore usi su Ubuntu

cat /proc/cpuinfo

e quale su Win?

Se hai problemi sono qua...

[gabi.2437]

Cmq il grafico non tenerlo sempre attivo a mò di screensaver eh...se ti interessa lo apri, lo guardi un pò e poi chiudilo che mangia risorse preziose allo scaccolo
Come screensaver usa la modalità "risparmio energetico" che spegne il monitor se inutilizzato, così almeno non sprechi energia elettrica inutilmente

[djtux]

Io invece ho un solo computer.... con un criceto AMD Athlon64 3200.
Il fatto è che su linux per elaborare una wu ci mette ALMENO il doppio del tempo che ci mette su windows... almeno il doppio!! (parlando di uno stesso progetto...).
Non è mica bello!
La mia attuale distro linux è Slackware 11 con il kernel 2.6.18, ma ho soltanto installato il kernel generico... non l'ho ancora ricompilato... che sia questa la causa di tale rallentamento? Anche su Ubuntu comunque mi succedeva la stessa cosa... e Ubuntu era a 64 bit, il che credo c'entri poco...
Come devo fare affinché Linux elabori le wu quantomeno impiegando lo stesso tempo di windows? (magari fosse più veloce!).

[Dominus]

processor : 0
vendor_id : GenuineIntel
cpu family : 15
model : 3
model name : Intel(R) Pentium(R) 4 CPU 2.80GHz
stepping : 3
cpu MHz : 2793.476
cache size : 1024 KB
fdiv_bug : no
hlt_bug : no
f00f_bug : no
coma_bug : no
fpu : yes
fpu_exception : yes
cpuid level : 5
wp : yes

----------------------

su win l'ho messo come screensaver.. come lo tolgo'???
e poi.. c'è il modo di mettere boinc in modaltà ridodtta su linux??? in modo che non si veda neanche la finestrella abbassata?? cosi non riscio che lo chiudano per sbaglio.

[schizzobau]

Originariamente inviato da Dominus

processor : 0
vendor_id : GenuineIntel
cpu family : 15
model : 3
model name : Intel(R) Pentium(R) 4 CPU 2.80GHz
stepping : 3
cpu MHz : 2793.476
cache size : 1024 KB
fdiv_bug : no
hlt_bug : no
f00f_bug : no
coma_bug : no
fpu : yes
fpu_exception : yes
cpuid level : 5
wp : yes

Ce l'ho anche io quel procio, e non ha l'Hyper Threading
(no HT = 1 solo core = 1 sola WU alla volta)

Originariamente inviato da Dominus

su win l'ho messo come screensaver.. come lo tolgo'???
e poi.. c'è il modo di mettere boinc in modaltà ridodtta su linux??? in modo che non si veda neanche la finestrella abbassata?? cosi non riscio che lo chiudano per sbaglio.

io ho istallato il core e il manager, e scaccola anche quando ho il manager chiuso (apt power! )

[Dominus]

come fai??? nel senso.. come faccio ad eseguirlo e farlo funzionare come se fosse un processo in back ground senza bisogno di aprire la grafica?

[novalis2]

ma quindi con linux si vede il grafico di seti??? se si..come?...io ho ubuntu . come si fa??? grazie

[Sancio77]

Originariamente inviato da Dominus

come fai??? nel senso.. come faccio ad eseguirlo e farlo funzionare come se fosse un processo in back ground senza bisogno di aprire la grafica?

Basta andare nella directory di BOINC ed eseguire:
./boinc -redirectio &
prova anche con l'opzione -daemon, ma se ricordo bene non sempre funziona come dovrebbe

Non sono pratico della versione "debianizzata" ma se usi boinc standard basta che esegui:
.../BOINC/run_client -redirectio &

Se a questo punto lanci il manager:
.../BOINC/run_manager &
(cd .../BOINC && ./boincmgr &)

questo si connette al client già in esecuzione, non mi ricordo di aver mai avuto problemi a vedere la grafica di Seti...

In giro dovresti trovare degli esempi di script per eseguire boinc al avvio del computer.
Aspetta in questo caso potresti avere problemi a vedere la grafica,
ma se lo script esegue boinc a nome del utente con cui ti loggi (ad esempio con sudo -H -u utente ...) e se nello script c'é export DISPLAY=:0 dovrebbe funzionare...
L'utente non é indispensabile che sia lo stesso, basta un xhost +localhost
Potrei anche sbagliare sono secoli che non uso boinc su un Linux con grafica.

Sulle prestazioni non so che dire é possibile che i client seti ufficiali siano meno ottimizzati di quelli Winzzoz, io di solito uso i client moddati.
I mod Crunch3r (scomparsi prematuramente) che uso ora non mi sembrano eccessivamente performanti (almeno non come i vecchi client non enhanced sempre di Crunch3r), prova magari questi:
http://lunatics.at/

Beh magari assicurati che non ci sia qualcos'altro che ciuccia CPU con un top.

Qui c'é il mio P4 3GHz:
http://setiathome.berkeley.edu/show_...hostid=2323823

[Dominus]

Grazie.. domani provo..

[wubby]

Originariamente inviato da novalis2

ma quindi con linux si vede il grafico di seti??? se si..come?...io ho ubuntu . come si fa??? grazie

Devi usare il boincmanager. Io ho installato il pacchetto da Debian. Installa quello per Ubunzu.

Per visualizzare il grafico devi andare su Tasks, cliccare sulla WU in elaborazione e poi (a sx) su Show graphics.

[wubby]

Io uso il client boinc originale, non pacchettizzato.
Per eseguirlo ad ogni avvio, ho scaricato un script e l'ho copiato in /etc/init.d ed ho creato un link su /etc/rcS.d

All'interno dello script devi indicare l'utente e le opzioni da usare.
Una volta fatto, non ci pensi più e se vuoi controllare che tutto vada bene usi il manager.

[wubby]

#!/bin/sh

# boincctl - Control boinc.  Stop it/Start it/Restart it.  Originally 
#            meant to be used as a boot time script so that boinc starts
#            at boot time, but can be used any time.  For a boot time script
#            put this in /etc/init.d and make the appropriate links from
#            the appropriate run level areas (ie. /etc/rc3.d).  (This was
#            developed on RedHat 9 so I know what the boot areas are there.
#            It should also work on Solaris,  I'm not familiar with other
#            flavors of Linix/UNIX.)

# Author:    Charles Dennett/Rochester, NY USA.
# Email:     [email protected]
# Date:      December 12, 2003.
# Version:   1.0
#
# History:   Version 1.1.  May 20. 2004.
#            Update stop function to use SIGTERM (15).
#            Version 1.2.  September 18, 2004
#            Comments about functions.
#
# Comment:   Copyright by the author.  Feel free to make modifications.
#            However, please keep these comments intact.

# Use:       To start:   boincctl start
#            To stop:    boincctl stop
#            To restart: boincctl restart
#            Status:     boincctl status

#
# Variables that will need to be configured.
#
#  BOINC_HOME:  The directory where boinc will run.  It should be run
#               in its own directory to keep its files and subdirectories
#               separate form others.
#
#  BOINC_BIN:   The full path to the boinc executable.
#
#  RUN_AS:      Username that boinc is to run as.
#
#  BOINC_OUT:   File to direct output from boinc.  If you don't want this,
#               set it to /dev/null.
#
#  BOINC_PARMS: Any command line parameters for boinc you wish to pass to 
#               it.  If you don't want any, simply use a null list ("").

BOINC_HOME=/home/wubby/boinc
BOINC_BIN=/home/wubby/boinc/boinc
RUN_AS=wubby
BOINC_OUT=boinc.out
BOINC_ERR=boinc.err
BOINC_PARMS="-return_results_immediately"

# Functions  This is for RedHat 9.  Don't know if it exists in other
# flavors of *nix.  If this does not work for you, simply comment it out
# and fix the stop function below so that it does not use the killproc
# function since killproc is defined in the functions file.  pkill might
# be a good choice.  Examine other boot scripts to see how they do it.

#. /etc/init.d/functions

# No other changes needed below this, most likely.

start()
{
   echo "Starting boinc"
   eval $SU_CMD
}

stop()
{
   echo -n "Stopping boinc"
#   pkill -15 `basename $BOINC_BIN`
   killproc `basename $BOINC_BIN` -15
}

restart()
{
   stop
   echo  "Be patient.  Waiting 10 seconds for all to stop."
   sleep 10 
   start
}

#----------------------------------------------------------------------------
#
# Start of mainline code
#

# If the user running this script is not the user we want boinc to run as, set
# up the su command so that we can become that user.  Note, we will have to 
# know this user's password.  If this script is run at boot time, it is root
# that is running this script and no password is required.

WHO_AM_I=`whoami`
CMD="$BOINC_BIN $BOINC_PARMS >> $BOINC_OUT 2>> $BOINC_ERR &"

if [ "$WHO_AM_I" != "$RUN_AS" ]; then
   SU_CMD="su $RUN_AS -c \"$CMD\""
else
   SU_CMD=$CMD
fi



# Go to where we want boinc to run

cd $BOINC_HOME

case "$1" in
  start)
         start
         ;;
  stop)
         stop
         ;;
  restart)
         restart
         ;;
  status)
         echo "What do I do here for status?"
         tail -20 $BOINC_OUT
         ;;
  *)
         echo "Usage:     `basename $0` start|stop|restart|status"
         exit 1
         ;;
esac

[Dominus]

allora.. ho provato con: run_client -redirectio & e dai processi risulta rosetta.. la cpu lavora al 100% quindi ha funzionato.. però adesso se tento di aprire il manager non si connette più al client che è già in uso.. mi dice password incorrect. ma la pass non me l'ha mai chiesta.

[Dominus]

ecco adesso ho capito come risolvere. quando si apre il manager dirà che la password non è corretta, quindi basta cliccare sopra nel menu per connettersi ad un computer e basta digitare l'ip o il nome del computer togliendo la password che lui mette (lasciarlo vuoto) e si connette senz<a problemi. p.s quindi quel comando funziona era gia al 33% .

[gabi.2437]

Originariamente inviato da Dominus

Azz però... a casa con un intel 3.0 Ghz una caccola di roseta la fa in 1 ora.. qui al lavoro con un intel a 2.80 Ghz (quasi) .. ci mette 8 ore.. anche con sistema operativo diverso.. a casa win e qui al lavoro linux.

Ma chissà perchè

Lo sai vero che su rosetta decidi tu quanto far durar una WU? L'elaborazione di una wu di rosetta elabora vari modelli, a seconda del tempo che metti, elabori per più o meno tempo quella wu (elaborando quindi meno o più modelli)

Va da se che siccome ai ricercatori servono centinaia di migliaia di modelli e che quindi le wu che tengono su sono una decina o più per volta (mettono su quelle wu fino ad aver tutti i modelli e poi altre e così via) se scarichi 40wu è probabile che alcune ricompaiano

[Dominus]

Quindi dici che lo stesso lavoro magari lo faccio 2 volte di seguito?? quindi sarebbe lavoro sprecato?

[gabi.2437]

Originariamente inviato da Dominus

Quindi dici che lo stesso lavoro magari lo faccio 2 volte di seguito?? quindi sarebbe lavoro sprecato?

No perchè ai ricercatori interessano i modelli di una wu

Loro hanno mettiamo 10 proteine la cui struttura reale è nota e con l'algoritmo che studiano, riuscire a elaborar la struttura via boinc (così da sfruttar l'algoritmo per scoprire la struttura di quelle proteine di cui è sconosciuta)

Quindi mandano wu contenenti i dati di 1 proteina ai vari pc i quali elaborano decine di modelli l'uno, alla fine i ricercatori mettono assieme le migliaia di modelli e vedono i risultati, quali sono giusti e così via

Ora, siccome le proteine sono solo 10 sia che la wu la fai durar 24 ore o che ti scarichi 24 wu da 1 ora l'una, non cambia nulla perchè devi elaborar modelli

[Dominus]

Capito.. chiarissimo grazie..