Consiglio Notebook per Lavoro (Bioinformatica)

[RevolverFox]

Buonasera a tutti!
Innanzitutto volevo ringraziarvi per la vostra disponibilità nell'aiutare la community mettendo a disposizione la vostra esperienza e i vostri consigli. In questi giorni ho letto dozzine dei vostri interventi e un'idea me la sono fatta. Tuttavia, vista l'esigenza particolare e non essendo totalmente certo del budget, volevo chiedervi anch'io gentilmente un consiglio ad hoc.

Ad ottobre inizierò il dottorato in bioinformatica. Essenzialmente devo produrre degli script con linguaggi come Python, Perl e R che lavorino con file testuali di grosse dimensioni (min 400 MB max anche 3 GB) al fine di estrapolarne i dati di mio interesse. L'operazione credo stressi molto la RAM ma anche la CPU (soprattutto quando si tratta di vagliare differenze o uguaglianze tra due file che contengono ognuno migliaia di entry). Il PC dovrà accogliere Debian ma probabilmente avrò bisogno di virtualizzare Windows per alcuni programmi non molto impegnativi. A me piace molto l'Acer vn7-591g-77h tra quelli che avete consigliato spesso però sarebbe per me uno sforzo economico non indifferente e vorrei capire se posso spendere di meno. Non ci devo giocare (per cui credo di poter far tutto con la scheda integrata) e non è necessario il Full HD, non ho bisogno di ssd, non ho preferenze di peso o di durata della batteria (in quanto lo terrò costantemente alla presa elettrica). Inoltre c'è da dire che le operazioni più complesse le delegherò al server del laboratorio quindi più che altro mi servirà per lavorare da casa (che è comunque la minor parte del tempo) ma dovendomi trasferire fuori sarà comunque il mio PC principale.

Secondo voi un PC con Intel Core i7-5500U come il Lenovo B50-80 aggiungendo altri 4 GB di RAM può essere un buon compromesso oppure per il mio utilizzo mi serve assolutamente un Quad Core come i7-4710HQ? In ambito desktop con una APU della famiglia A6 già si riesce a condurre questo tipo di analisi in tempi ragionevoli...
Cosa mi consigliate? Sono senza speranze? :P

Grazie mille dell'aiuto!

[andy45]

Originariamente inviato da RevolverFox

Secondo voi un PC con Intel Core i7-5500U come il Lenovo B50-80 aggiungendo altri 4 GB di RAM può essere un buon compromesso oppure per il mio utilizzo mi serve assolutamente un Quad Core come i7-4710HQ? In ambito desktop con una APU della famiglia A6 già si riesce a condurre questo tipo di analisi in tempi ragionevoli...
Cosa mi consigliate? Sono senza speranze? :P

Traduci tempi ragionevoli, con un i5-5200U sei già al di sopra (non di molto) delle performance di un A6-7400K, visto che l'i7-5500U è poco più performante dell'i5 dovrebbe andare bene...il tutto però dipende dai "tempi ragionevoli".

Riguardo all'ssd secondo me ti velocizzerebbe molto il lavoro, cmq puoi sempre aggiungerlo in seguito.

[Manuel Ferrari]

Originariamente inviato da RevolverFox

Buonasera a tutti!
Innanzitutto volevo ringraziarvi per la vostra disponibilità nell'aiutare la community mettendo a disposizione la vostra esperienza e i vostri consigli. In questi giorni ho letto dozzine dei vostri interventi e un'idea me la sono fatta. Tuttavia, vista l'esigenza particolare e non essendo totalmente certo del budget, volevo chiedervi anch'io gentilmente un consiglio ad hoc.

Ad ottobre inizierò il dottorato in bioinformatica. Essenzialmente devo produrre degli script con linguaggi come Python, Perl e R che lavorino con file testuali di grosse dimensioni (min 400 MB max anche 3 GB) al fine di estrapolarne i dati di mio interesse. L'operazione credo stressi molto la RAM ma anche la CPU (soprattutto quando si tratta di vagliare differenze o uguaglianze tra due file che contengono ognuno migliaia di entry). Il PC dovrà accogliere Debian ma probabilmente avrò bisogno di virtualizzare Windows per alcuni programmi non molto impegnativi. A me piace molto l'Acer vn7-591g-77h tra quelli che avete consigliato spesso però sarebbe per me uno sforzo economico non indifferente e vorrei capire se posso spendere di meno. Non ci devo giocare (per cui credo di poter far tutto con la scheda integrata) e non è necessario il Full HD, non ho bisogno di ssd, non ho preferenze di peso o di durata della batteria (in quanto lo terrò costantemente alla presa elettrica). Inoltre c'è da dire che le operazioni più complesse le delegherò al server del laboratorio quindi più che altro mi servirà per lavorare da casa (che è comunque la minor parte del tempo) ma dovendomi trasferire fuori sarà comunque il mio PC principale.

Secondo voi un PC con Intel Core i7-5500U come il Lenovo B50-80 aggiungendo altri 4 GB di RAM può essere un buon compromesso oppure per il mio utilizzo mi serve assolutamente un Quad Core come i7-4710HQ? In ambito desktop con una APU della famiglia A6 già si riesce a condurre questo tipo di analisi in tempi ragionevoli...
Cosa mi consigliate? Sono senza speranze? :P

Grazie mille dell'aiuto!

Per il tuo uso sarebbe d'obbligo un quad core come un i7-4710hq, che trovi anche a poco più di 500 euro ma con scheda grafica abbastanza scarsa che però non userai mai quindi non ti serve, altrimenti sui 700 prendi lo stesso i7 ma con gtx850m....dimmi tu....

[andy45]

Originariamente inviato da Manuel Ferrari

Per il tuo uso sarebbe d'obbligo un quad core come un i7-4710hq

Dipende, faccio lavori di analisi numerica, che sono simili e sinceramente a parte rari casi si lavora bene anche con pc poco performanti...dipende molto dal set di dati che si sta analizzando.
In questo ambito bisogna partire dal presupposto che molti lavori non si possono fare su pc normali, men che meno su dei notebook, per questo ero interessato a conoscere i tempi ragionevoli, se si parla di 10 minuti, mezzora ok, allora ci si può orientare anche su computer meno performanti, se si parla già di un'ora no, allora c'è bisogno assolutamente di un quad.

[Manuel Ferrari]

Originariamente inviato da andy45

Dipende, faccio lavori di analisi numerica, che sono simili e sinceramente a parte rari casi si lavora bene anche con pc poco performanti...dipende molto dal set di dati che si sta analizzando.
In questo ambito bisogna partire dal presupposto che molti lavori non si possono fare su pc normali, men che meno su dei notebook, per questo ero interessato a conoscere i tempi ragionevoli, se si parla di 10 minuti, mezzora ok, allora ci si può orientare anche su computer meno performanti, se si parla già di un'ora no, allora c'è bisogno assolutamente di un quad.

Ma se il budget lo permette perché non andare direttamente su un quad core tanto l'autonomia non interessa ne tanto meno le dimensioni quindi avrà anche un pc che durerà più anni e se incomincerà a fare cosa più difficili avrà un pc che glielo permetterà

[Simonex84]

Più che la CPU io andrei a potenziare RAM e disco, lavorando su file così grandi i tempi di accesso sono quelli che rallentano il tutto.

Io metterei 16gb di ram e un SSD tipo un 850 Pro.

Probabilmente l'ideale sarebbe un MacBook con SSD integrato su PCI-e da 2,0 GBps

[Manuel Ferrari]

Originariamente inviato da Simonex84

Più che la CPU io andrei a potenziare RAM e disco, lavorando su file così grandi i tempi di accesso sono quelli che rallentano il tutto.

Io metterei 16gb di ram e un SSD tipo un 850 Pro.

Probabilmente l'ideale sarebbe un MacBook con SSD integrato su PCI-e da 2,0 GBps

Si quello sarebbero upgrade necessari ma come cpu al di sotto di un i7-4710hq non si deve andare, poi quel Mac è un consiglio assolutamente folle 😁....spero scherzavi....

[Simonex84]

Originariamente inviato da Manuel Ferrari

Si quello sarebbero upgrade necessari ma come cpu al di sotto di un i7-4710hq non si deve andare, poi quel Mac è un consiglio assolutamente folle ��....spero scherzavi....

Non scherzavo per niente, anche io per la tesi ho dovuto smazzarmi file immensi e con un PC messo meglio si guadagnano ore ed ore di lavoro, per quanto mi riguarda il tempo ha più valore del denaro, se con 1000€ in più di macchina magari si guadagnano 2-3 ore di computazione al giorno è una gran cosa.

Se poi non vi piace il Mac basta trovare un Pc-windows con un SSD dalle caratteristiche simili

[andy45]

Originariamente inviato da Manuel Ferrari

Ma se il budget lo permette perché non andare direttamente su un quad core tanto l'autonomia non interessa ne tanto meno le dimensioni quindi avrà anche un pc che durerà più anni e se incomincerà a fare cosa più difficili avrà un pc che glielo permetterà

Perchè non è detto sia la scelta migliore, ad esempio dovendo mettere debian conviene di più avere un notebook con la sola vga integrata, crea molti meno problemi in fase di installazione e configurazione, di quad con la sola integrata a parte rarissimi casi (costosi) non ne ho mai visti; un quad core scalda nettamente di più, e visto che il pc starà fermo su una scrivania, quindi maggiormente soggetto ad accumulare polvere, è più facile che con il tempo tenda a surriscaldarsi, quindi anche la manutenzione sarebbe maggiore...di motivi per non prendere un quad ce ne sono tanti, e altrettanti sono i motivi per prenderlo ...dipende molto da questi famosi tempi ragionevoli.

[RevolverFox]

Originariamente inviato da andy45

Traduci tempi ragionevoli, con un i5-5200U sei già al di sopra (non di molto) delle performance di un A6-7400K, visto che l'i7-5500U è poco più performante dell'i5 dovrebbe andare bene...il tutto però dipende dai "tempi ragionevoli".

Riguardo all'ssd secondo me ti velocizzerebbe molto il lavoro, cmq puoi sempre aggiungerlo in seguito.

Ciao andy, per tempi ragionevoli diciamo che a seconda del tipo di analisi e dei file di input ci impiego dai pochi secondi ai 15 (max 20) minuti con quella CPU. Tuttavia altri tipi di analisi richiedono anche mezza giornata (o più) su quelle configurazioni (A6 con 4GB di RAM) e per questo di solito le facciamo fare ai server.
Per cui da quel che mi dici deduco che col 5500 avrei una macchina decente per lavorare anche casa ma comunque non eccezionale.

Originariamente inviato da Manuel Ferrari

Per il tuo uso sarebbe d'obbligo un quad core come un i7-4710hq, che trovi anche a poco più di 500 euro ma con scheda grafica abbastanza scarsa che però non userai mai quindi non ti serve, altrimenti sui 700 prendi lo stesso i7 ma con gtx850m....dimmi tu....

Ciao Manuel, per quanto riguarda la grafica io faccio spesso analisi statistiche che si traducono in plot (utilizzo R, un programma/linguaggio leggero a linea di comando) con risoluzioni variabili (a volte anche abbastanza alte). Tuttavia con la Radeon HD5450 che ho a casa non ho mai avuto alcun tipo di problema e per questo stavo dando per scontato che non mi servisse una vga dedicata (presumo che una intel HD5500 di oggi seppur integrata sia comunque migliore della mia vga), faccio male? Se ho ragione di pensarla così forse potremmo virare effettivamente sulla soluzione che avevi in mente sui 500 euro se pensi che abbia un sistema di raffreddamento sufficiente.

Grazie davvero a entrambi per l'interessamento, siete gentilissimi!

EDIT:
Grazie anche a te Simonex84 per la risposta. Non sono però orientato a puntare sui Mac e non sono sicuro di sfruttare 16 GB di Ram. Più che altro, sempre considerando che resto pur sempre un biologo e non sono espertissimo di hardware, suppongo che la cosa che mi interessi di più nel mio caso sia la velocità di accesso della CPU alla RAM.

Andy penso che hai centrato in pieno il problema. Mi pare di capire che facciamo operazioni simili dal punto di vista dello sforzo computazionale.

[Manuel Ferrari]

Originariamente inviato da Simonex84

Non scherzavo per niente, anche io per la tesi ho dovuto smazzarmi file immensi e con un PC messo meglio si guadagnano ore ed ore di lavoro, per quanto mi riguarda il tempo ha più valore del denaro, se con 1000€ in più di macchina magari si guadagnano 2-3 ore di computazione al giorno è una gran cosa.

Se poi non vi piace il Mac basta trovare un Pc-windows con un SSD dalle caratteristiche simili

Appunto trovi dei Windows con pcle tipo l'asus ux501 che viene 1600 euro e ha anche una bella scheda grafica dedicata....

[andy45]

Originariamente inviato da RevolverFox

Ciao andy, per tempi ragionevoli diciamo che a seconda del tipo di analisi e dei file di input ci impiego dai pochi secondi ai 15 (max 20) minuti con quella CPU. Tuttavia altri tipi di analisi richiedono anche mezza giornata (o più) su quelle configurazioni (A6 con 4GB di RAM) e per questo di solito le facciamo fare ai server.
Per cui da quel che mi dici deduco che col 5500 avrei una macchina decente per lavorare anche casa ma comunque non eccezionale.

Ok esattamente come i miei lavori, l'i7-5500u ti farebbe lavorare decentemente, certo i lavori da mezza giornata invece di 12 ore sarebbero al massimo 11 ore e 20 minuti (voglio essere generoso), insomma continueresti a non poterli fare...con un quad più o meno dimezzeresti la cosa, da 12 ore diventerebbero 7...per quel che mi riguarda sono cmq tante e quindi risulterebbe poco conveniente farle a casa su un notebook, magari per te invece è un ottimo compromesso, questo puoi deciderlo solo tu.

[Manuel Ferrari]

Quello che ti volevo consigliare con 500 euro è l'asus k550jd, i7-4710hq e gt820m

[andy45]

Originariamente inviato da Manuel Ferrari

Appunto trovi dei Windows con pcle tipo l'asus ux501 che viene 1600 euro e ha anche una bella scheda grafica dedicata....

La scheda grafica dedicata per questi lavori non serve a niente, la hd4000 del mio economicissimo asus è anche troppo .

[RevolverFox]

Perfetto, intanto segno l'ASUS tra le scelte papabili e a buon mercato per avere un PC diciamo così "a tutto tondo". Grazie mille per l'aiuto

Invece Andy per quanto riguarda il tuo ragionamento mi piace molto il confronto di tempo tra il dual e il quad core e in effetti si per me 7 ore sarebbero comunque tante e in quel caso estremo lancerei l'analisi "over night". Ok, quindi una configurazione con l'i7-5500u e vga integrata che mi permetta di aggiungere agilmente un altro banco da 4 GB di Ram in dual channel (o che abbia 8 GB di suo) esiste?

Graze mille e perdonatemi per il tempo che vi sto sottraendo.

[Manuel Ferrari]

Originariamente inviato da andy45

La scheda grafica dedicata per questi lavori non serve a niente, la hd4000 del mio economicissimo asus è anche troppo .

Io stavo facendo il paragone con il mbp, per dire che è anche meglio.

Originariamente inviato da RevolverFox

Perfetto, intanto segno l'ASUS tra le scelte papabili e a buon mercato per avere un PC diciamo così "a tutto tondo". Grazie mille per l'aiuto

Invece Andy per quanto riguarda il tuo ragionamento mi piace molto il confronto di tempo tra il dual e il quad core e in effetti si per me 7 ore sarebbero comunque tante e in quel caso estremo lancerei l'analisi "over night". Ok, quindi una configurazione con l'i7-5500u e vga integrata che mi permetta di aggiungere agilmente un altro banco da 4 GB di Ram in dual channel (o che abbia 8 GB di suo) esiste?

Graze mille e perdonatemi per il tempo che vi sto sottraendo.

Certo che si trova, stiamo sui 550 con un Acer v3

[andy45]

Originariamente inviato da RevolverFox

Invece Andy per quanto riguarda il tuo ragionamento mi piace molto il confronto di tempo tra il dual e il quad core e in effetti si per me 7 ore sarebbero comunque tante e in quel caso estremo lancerei l'analisi "over night". Ok, quindi una configurazione con l'i7-5500u e vga integrata che mi permetta di aggiungere agilmente un altro banco da 4 GB di Ram in dual channel (o che abbia 8 GB di suo) esiste?

Con la sola integrata se ne trovano per lo più tra i pc professionali, tanto per dirne uno l'hp probook 450 G2 con i7-5500U, vga integrata, 4 gb di ram, hd 500 gb, schermo 15,6'' 1366x768 lo si trova sui 600 €.
Commerciali con dedicata invece l'acer v3-572g (i7-5500U, 8 gb di ram, 1 tb di hd, gt 820M 2 gb, schermo 15,6'' 1366x768) lo trovi sui 550 €, sui 570 € c'è l'HP 15-p264nl identico al precedente, ma con la 830M e hd da 750 gb, sui 600 € invece il toshiba L50-B-24C, anche questo come il primo acer, solo che invece della 820M ha la radeon R7 M260...te lo metto anche se so che lo scarterai per via della vga ati che con linux fa un po' a cazzotti .

[andy45]

Originariamente inviato da Manuel Ferrari

Io stavo facendo il paragone con il mbp, per dire che è anche meglio.

Ah ok scusami, non avevo capito .

[RevolverFox]

Ragazzi non so come ringraziarvi davvero, mi avete risolto non pochi dubbi e mi avete aiutato a limare un bel po' risparmiando parecchi soldi. Mi segno gli Acer della serie v3 che sembrano ottime macchine. Effettivamente anche se AMD è migliorata molto credo che se proprio prenderò un notebook con la vga dedicata ci andrò di nvidia per questa volta.

Quindi alla fine mi devo decidere tra quad e dual core soppesando bene i pregi e i difetti di entrambi (ma sono molto propenso per l'i7 5500u). L'unica cosa che non ho capito è la differenza tra i pc commerciali e quelli professionali. Voglio dire quell'hp probook 450 G2 mi pare offra un po' meno rispetto ai diretti concorrenti nella stessa fascia di prezzo, con cosa compensa? Una qualità costruttiva superiore?

[andy45]

Originariamente inviato da RevolverFox

Voglio dire quell'hp probook 450 G2 mi pare offra un po' meno rispetto ai diretti concorrenti nella stessa fascia di prezzo, con cosa compensa? Una qualità costruttiva superiore?

In teoria sono progettati meglio (difficilmente scaldano o sono rumorosi), cmq non sempre valgono il prezzo che costano, di listino il modello che ti ho segnalato costa 700 €, un prezzo folle, online si trova a 600 €, che è sempre un prezzo alto per quello che offre, ma cmq più appetibile.