Non esiste master e slave nello standard SATA.
Ogni canale risulta dedicato ad una singola periferica.
Quindi se hai 2 canali Sata potrai collegare al massimo due periferiche mentre se hai due canali Eide puoi collegare fino a 4 periferiche (impostando master/slave).
Da Bios puoi invece impostare quale periferica vuoi usare per il boot (come sempre).