Python in Networks Complex

[pabloski]

Originariamente inviato da mic_1

In merito alla possibilità di gestire i Big Data nello studio delle reti biologiche dici che possa farlo?

A parte l'hype intorno a questi termini assurdi. Ma si, i big data sono "tantissimi dati correlati". I metodi sono più o meno sempre gli stessi. Che riguardino lo studio di sistemi biologici o difetti dei materiali, non c'è differenza.

Originariamente inviato da mic_1

In questo caso forse dovrei considerare reti di più tipologie connesse tra loro? (più argom bio interconnessi)

Ma queste cose si fanno quando hanno senso. Mischi una CNN con un ensemble ( per esempio )? Il risultato sarà al 99% un disastro.

Dietro ogni architettura di rete complessa ( neurale, biologica, un processo markoviano o che altro ) ci sono decenni di studi, prove ed errori, teoremi matematici dimostrati e alcuni ancora da dimostrare.

Non produci qualcosa di logico e funzionante mischiando roba a casaccio.

Originariamente inviato da mic_1

Il prof mi ha tirato fuori il discorso del Cloud...

Come esempio. Il cloud computing non è altro che la messa in comune, da parte di un vasto array di computer, di risorse di calcolo, di archiviazione dati e periferiche.

Ed è un termine esclusivamente relativo alle reti telematiche.

[mic_1]

Mi potete consigliare una pagina dove scaricare file di Big Data reali in biologia?

quelli presenti in Cytoscape possono andar bene? Grazie

[mic_1]

Ciao a tutti e Buon Anno!

Ho completato la prima parte, legata allo studio dei Networks,

ora devo provare ad inserire la parte di Cinetica tipo la 'costante di Michaelis-Menten' enzimatica ma non saprei quale libreria usare, sempre ce ne sia una.

Mi pare che Biopython sia più legata al genoma più che al proteoma.

Qualcuno che mi sappia consigliare? Grazie!!!