confermo gtkpod funziona benone a parte qualche piccolo buggetto, sennò le nuove versioni di amarok (molto bello, player musicale in qt) e rhythmbox (idem ma gtk) dovrebbe supportare pienamente ipod.
era uscito tra l'altro qualche tempo fa un link a una guida su come utilizzare ipod con amarok, puoi vedere se la trovi

era su slashdot
ciao!
EDIT: qui trovi molte info per far andare l'iPod con amarok.. è una specie di how-to per ubuntu, ma va bene su ogni distro of course, basta prendere nel caso qualche piccolo accorgimento...
http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=33079