se leggi il documento che ti ho postato all'inizio, lì c'è scritto passo passo le fasi da seguire per la migrazione.
Comunque la migrazione si fa dopo aver installato il server, è un wizard per cui non è complicato.
Spostare sbs su un nuovo hardware non è affatto semplice, se cambiano i MAC address delle schede di rete non ti funziona più nulla. Per questo si usano delle schede di rete "fittizie" per ingannare l'SO. A dire il vero con 2000 sbs non l'ho mai fatto, l'ho fatto con 2003 ed alla fine ho dovuto comunque avviare la console per disabilitare a mano un po' di servizi perché non voleva partire.
Ti consiglio installazione pulita + migrazione, dato che non hai niente di strano è la via ufficiale
Se exchange lo usi per la mail interna nessun problema..