tanto per rimanere sul leggero e sul generale, le pipeline sono le catene di montaggio attraverso le quali viene elaborata l'intera scena 3d.
Attraverso le vertex pipeline prende forma l'intera geometria, lo "scheletro" della scena, assieme a vari effetti ottenibili con l'uso dei vertex shader; le pixel pipeline invece si occupano di operare gli effetti sui pixel, quindi tutto ciò ke riguarda pixel shader, vari bump mapping, effetti di blur, hdr eccetera

detto MOLTO alla buona..se vuoi approfondimenti posta domande più specifiche oppure leggiti uno degli articoli tecnici che trovi su google (purtroppo non ne conosco gli indirizzi)
bYeZ!