Io credo proprio che è molto più semplicemente un problema di driver: il passaggio da nvidia ad ati e viceversa molto spesso da problemi, o cumunque non garantisce performance al 100%.
Abbi pazienza e formatta, vedrai che va tutto a posto.
PS: formatta, poi subito SP2, poi dirver chipset (agp, ide, lan, ecc...), poi driver ati 5.4 poi driver audio e solo dopo i programmi.
Ciao