Già ... c'erano pure gli HD ... insomma, silenziare il sistema è più complicato del previsto.
Ti occorre: dissy della CPU silenzioso (meglio se attivo comunque), alimentatore silenzioso (tipo Tagan o Zalman, comunque costano), box/cassettini per silenziare gli Hard Disk (sibilano e grattano, rinchiusi in un box tipo quello della silentmaxx non danno problmei), per il case utilizzare ventole il più silenziose e grosse possibili, per la scheda video ti consiglio il VGA silencer dell'arctic cooling.
Poi potresti passare a piazzare del fonoassorbente o molto meglio dell'antirombo sulle pareti del case per zittirlo ancora di più
!