[Nemios]

Non ho capito bene il tuo problema...

Partizioni differenti, ok.
Formattate in modo differente, ok.
Montate, ok.

Se il S.O. le legge entrambe (Linux sì, Winzozz no) allora basta un copia-incolla no?

Consigliabile? Dipende. Se devi mantenere entrambi i S.O. e vuoi continuare a leggere i dati da Win non puoi metterli su ext3, che però credo sia un file system superiore...