credo che installando windows ora la conseguenza sia questa:
linux non parte più perchè ti viene sovrascritto l'mbr con quello di windows e al riavvio successivo partirà solo windows.
l'unica cosa che devi fare e riuscire a farti un floppy di avvio per linux, così da poterla riavviare in quel modo e subito dopo riscrivi l'mbr con lilo o grub aggiungendo a questo punto l'avvio di windows.
aspetta conferma per ciò che ti ho detto ciao