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Secondo me il problema è un po' strano...
All'inizio pensavo che si fosse rotta l'elettronica del 40GB, e che questo impedisse l'avvio corretto, ma poi arrivato in fondo comincio a pensare che sia il 160Gb vecchio ad avere problemi di elettronica, mentre la cosa strana è che ha funzionato per un po'.

Potrebbe anche essere qualcosa di molto più semplice:
innanzitutto ricorda che su ogni cavo devi mettere un master ed uno slave, e che questo è determinato dai jumper sul retro delle unità, e non dalle posizioni sul cavo.
Quindi controlla se questo discorso è a posto.
Poi quando avvii devi settare nel bios, in advanced Bios, nella Boot sequence in quale posizione si trova il disco col s.o., ad esempio primary master.
Se tutte queste cose le hai controllate e sono ok, prova a collegare il disco vecchio 160 sull'altro canale (cioè sull'altro cavo), e vedere se così parte. Insomma prova a spostarli in tutte le posizioni, e vedi se ce ne sono alcune da cui non parte, sempre aggiornando ogni volta la boot sequency nel bios.
Ogni tanto è capitato che dischi buoni si rifiutassero di lavorare in determinate posizioni.

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