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Innanzitutto ti consiglio di mettere l'altro HD nell'altro bus.
poi in genere..
si partiziona cosi':
/
/home
/usr
/var
perche' se si fotte un FS nn perdi gli altri..
Poi dipende anche dalle tue esigenze...
Io per esempio adesso i server li partiziono tutti usando LVM
cosi' se devo cambiare le dimensioni delle partizioni (aggiungere spazio etc..) non ho problemi...
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...Ordunque...
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