detto in parole molto povere...
.la fat32 è quella usata sui sitemi 9x(windows98/ME),la ntfs dai sistemi nt(windows nt,xp..)
.oltre una certa dimensione devi formattare per forza in ntfs(non ricordo quale)
.l'ntfs è più "sicura"
.se il sistema operativo è su fat 32,non potrai accedere a una partizione ntfs,al contrario si.
.l'ntfs fa "occupare meno spazio ai file"
.su partizioni ntfs non puoi accedere da dos
.formatta in ntfs