Ora non ricordo molto bene come si fa perchè è molto che non ci metto mano. Per aggiungere dei file al progetto puoi usare un client qualsiasi per cvs con il tuo nome utente e password. per la pagina web dovresti usare un client ftp per collegarti al server. L'accesso viene fatto sempre tramite ssh quindi dovresti prima generare una chiave publica con ssh-keygen.
ciao