ufff....ho un problemone

Oggi l'ho messa in funzione per provarla ma mi sono accorto di aver commesso un errore....Le due pompe stanno sopra al coperchio e tramite due tubi pescano l'acqua dalla vasca sottostante. Purtroppo quando il circuito viene spento esce l'acqua dalla pompa e da parte del circuito per semplice effetto di gravità, in questo modo però al riavvio successivo la pompa non funziona perchè non riesce a pescare l'acqua in quanto funziona a vuoto. Come si può fare? L'unica è mettere le pompe nella vaschetta?