Se non è il disco in cui è installato windows entri in windows e formatti.
Se, cosa più probabile, è il disco di windows puoi:
1 - creare un disco dos di boot con i driver per controller e disco e formattare da dos;
2 - bootare con il cd di windows, inserire il floppy con i driver e formattare da lì.
Personalmente voto 1.
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