Che scheda madre hai? A me succedeva con una MSI KT4V (chipset Via KT400) usando schede TV... Purtroppo ho dovuto cambiare la scheda madre stessa (non era colpa dell'HD). Prova magari ad aggiornare i driver del chipset e quelli del controller IDE (nel caso di chipset Via scarica il pacchetto Hyperion).
Un probla di surriscladamento è ipotizzabile... che temperature rileva la scheda madre?
Fammi sapere,
Marco