Confrontare una Gentoo con una Debian Stable ha poco senso...
Troppe le differenze a livello di versioni dei programmi installati
Come gestione sono simili apt ed emerge alla fine è solo questione di gusti...
Voglio solo ricordare che con Gentoo non è obbligatorio installare da stage1 si può benissimo installare da stage 2 o 3 e in poco tempo hai il sistema installato, scaricando lo stage per il propio processore sono anche abbastanza ottimizzati...
Grosso punto a favore della gentoo secondo me sono le molte guide disponibili sul sito, mltissime tradotte anche in italiano, e la comunità di utenti disponibile
Per Debian non ti so dire molto perchè la uso solo su un server a lavoro ed è la versione stable...