Se dici così allora penserei invece che l'SSD M.2 è difettoso, non la scheda madre o che manchi qualche impostazione di configurazione. La limitazione della velocità è dovuta dal fatto che lo slot M.2 su quella scheda madre è PCIe 3.0 x2, non x4, quindi da circa 3.500 MB/s si passa a massimo 1.700 MB/s. Tutto normale qui.
L'SSD è nuovo o usato? se usato, saresti disposto a scaricare
CrystalDiskInfo per fornire un immagino S.M.A.R.T.?