Il carattere > viene interpretato dalla shell come redirezione dell'output al file specificato dopo.
Per ottenere la stessa cosa in VB NET devi specificare tramite le proprietà di ProcessStartInfo che vuoi redirigere l'output e poi prendere lo stream e scriverlo dove vuoi.
Vedi l'esempio qui:
https://learn.microsoft.com/en-us/do...t?view=net-9.0