Magari postare nel forum VIDEO invece che in quello AUDIO ti aiuterebbe a trovare la risposta...
p.s. cercando con parole come >video smartphone upside down< trovo "tanta roba"... ci dovessi scommettere qualcosa direi che nel file originale c'é qualche tag che si perde nel passaggio avidemux... detto per inciso tra i filtri di rielaborazione immagine di avidemux quasi sicuramente (non ho verificato) c'é quello che fa la rotazione. Ciò però implica che il video venga ri codificato con perdita (più o meno sensibile) di qualità.