Xkè non prosegui nel tread già iniziato?
https://www.hwupgrade.it/forum/showthread.php?t=2951662
Quindi hai acquistato un'altra mobo identica senza risolvere il problema precedente ed in più creandone uno nuovo?
È improbabile che due mainboard identiche abbiano gli stessi problemi o simili e che non cambi niente facendo la sostituzione. Secondo me non sono guaste nessuna delle due. Può invece esserci una incompatibilità con linux, questo si, ed a quel punto dovresti proprio cambiare marca scegliendo qualcosa che monti anche chip differenti.
Se con solo windows tutto ti funziona e con linux o dualboot no, il problema non può essere la mainboard, quanto invece un'incompatibilità con linux.
--edit--
Devi continuare a fare delle prove prendendo tutte le tue periferiche comprese quelle usb con cui si manifestava il problema e metterle su un altro PC con linux o dualboot ed assicurarti che almeno quelle vadano regolarmente e non siano un ulteriore fonte di incompatibilità coi driver integrati in linux.