Ma non dovevi mettere uno SSD ed installare Windows ex novo sulla nuova unità? Se non ho dimenticato qualcosa mi pare che questo era il tuo intendimento.
Bene, apri il case del computer, scollega tutti gli hard disk, tutti. Collega l'SSD e lascia collegato solo lui, installa Windows sull'SSD. Alla fine, quando ti sei accertato che l'installazione è andata a buon fine e fa il boot, spegni il computer, collega i vari hard disk che desideri, accendi il computer, vai nel setup del BIOS, metti come prima unità di boot l'SSD se non lo è già, lascia avviare il nuovo Windows dell'SSD..
Fatto! Finito