[sottovento]

Non sai come fare con H2 oppure con java+database in generale?
Alcuni suggerimenti, poi dimmi se ho azzeccato quello che ti serve:
- scarica il driver jdbc per H2. Troverai un file con un nome del tipo "h2-1.4.193.jar" (la versione puo' ovviamente cambiare).
- metti quel file nel tuo CLASSPATH, oppure aggiungilo al progetto. Questa operazione dipende dall'IDE che stai usando. Per Netbeans, devi selezionare il progetto, poi right-click su Properties -> Libraries -> Add Jars
- Registra il driver ed effettua la connessione.
Per esempio:

    public static Connection createH2DatabaseConnection() throws SQLException, ClassNotFoundException
    {
        Class.forName("org.h2.Driver");
        Connection conn = DriverManager.getConnection("jdbc:h2:./testH2;IFEXISTS=TRUE", "sa", "");       // Questa serve ad aprire senza creare
        //Connection conn = DriverManager.getConnection("jdbc:h2:./testH2", "sa", "");  // Questa crea il database se non esiste
        return conn;
    }

Ora puoi usare la connessione per creare uno statement ed eseguire query