visto che la tua mobo ha un numero piuttosto elevato di connettori 4pin, io userei quelli. Per quanto riguarda le differenze tra questi ti conviene guardare da bios/applicazione asus per la gestione delle ventole (o dal manuale della mobo) che tipo di regolazione delle ventole pwm consente (quanto è "profondo" il controllo sulle ventole). Per il dissipatore non saprei, ma se ha due connettori 4pin, uno per ogni ventola, puoi comprare un cavo sdoppiatore 4pin e collegarle entrambe ad una sola porta 4pin dedicata alla cpu.
leggiti questa discussione,
http://www.hwupgrade.it/forum/showthread.php?t=2775250