più che alla cpu, che se cambi in toto la macchina risolverai senz'altro il problema, io punterei alla scheda audio o ai cavi utilizzati
quindi procederei così:
- sostituzione cavo di collegamento audio pc-casse (sempre che sia possibile)
- reinstallazione da zero dei driver audio prendendo quelli più aggiornati dal sito del produttore della scheda audio (realtek, creative eccetera), quindi non dal sito della scheda madre
- test con delle cuffie sulla stessa uscita audio
non ho poi capito bene la questione di iTunes

con iTunes senti tutto bene mentre con qualsiasi altro programma senti male?
ciao ciao
P.S.
benvenuto sul forum