[pigi2pigi]

Installa windows e lascia lo spazio per ubuntu libero e non formattato e lo formatti durante l'installazione, o a tua scelta formattato con file system ext4 o Btrfs secondo cosa preferisci.
Al minimo ubuntu installa la partizione principale e una per lo swap, lo swap (non è obbligatorio) mettilo sul secondo disco, inutile sfasciare la SSD.

Linux non ha problemi nell'accedere ai dischi ntfs di windows (a parte le prestazioni inferiori).
Il secondo disco lo puoi usare come vuoi se vuoi mettere una o più partizioni usate o solo da un sistema o da entrambi.