Per vedere chi occupa cosa, potresti usare Treesize Free:
http://www.jam-software.com/treesize_free/
Puoi ordinare le cartelle per grandezza e poi sfogliarle "ad albero".
Una volta che hai capito dove si nascondono i file incriminati, potrai farti un'idea del perché sono lì e di quanto siano utili/inutili per te.