Puoi provare anche con Mp3Splitter in formato portable >
http://mp3splitter.codeplex.com/releases/view/32697
Una volta avviato Mp3SplitterGui, seleziona la seconda voce Select + Start splitting e il file che contiene più tracce viene diviso in tracce singole .
Però qualcosa perdi.
Alrimenti uno di questi dove parlano anche dell' applicazione suggerita da marco che saluto
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http://www.lidweb.it/ind_topic.asp?topic_id=678