Questo è quanto dice Apple in merito:
http://support.apple.com/kb/TS2570?viewlocale=it_IT
Io personalmente consiglio una reinstallazione del sistema operativo.
Se hai un backup aggiornato, formatta proprio e reinstalla, recuperando poi completamente i dati dal backup.
Se non hai un backup recente, prova a reinstallare il SO dalla partizione di ripristino (il dvd di Lion non ha nulla di più al suo interno) senza formattare: se i dati non sono corrotti, basterà per far ripartire la macchina andando solo a sovrascrivere i dati di sistema.