[Esavoc]

Ciao.

MP4 splitter non entra in gioco durante la riproduzione di un mkv, penso sia inutile per risolvere il problema in questione.
Comunque dato che Visual Sub Sync si può anche non installare ho provato un pò. Anche a me non sempre riconosce l'audio negli mkv ma se rimuxo gli stessi video in mp4 il problema non si presenta più.
Secondo me è un bug del software, con due mkv che all'apparenza sembrano identici come flussi e come muxer, (uso sempre mkvmerge 5.0 e non versioni successive), cliccando sul bottone debug la catena dei filtri cambia a seconda del file anche se non dovrebbe.

Quindi per ora l'unico modo è aggirare il problema creando un mp4 dall'mkv usando Yamb che accetta direttamente gli mkv o mp4muxer ma devi dargli i flussi separati.