puoi procedere alla clonazione usando un programma dedicato che gestisca anche il raid, acronis true image lo fa dalla versione 8 in poi, la procedura è semplice e guidata, non devi sciogliere la matrice raid e scollegare alcunché, mi pare di ricordare solo al riavvio dovrai sciogliere il raid in quanto la clonazione chiamerà "C" il disco di sistema ed ovviamente non potrai avere 2 "C" e comunque il programma ti guiderà passo-passo.