[marcos86]

Non so esattamente cos'hai fatto ma basta:
1- andare sul sito di ubuntu e scaricare la iso
2- inserire una chiavetta usb di sufficienti dimensioni
3- aprire unetbootin e indicargli la iso e la chiavetta

Da quanto dici sembra che tu abbia "installato" la iso sul drive c invece che sulla chiavetta (visto che non dovrebbe assolutamente scompattare la iso nell'hdd). Se non hai inserito la chiavetta non dovrebbe neanche comparirti all'avvio la richiesta di avviare unetbootin...