mah secondo me l'idea di avere un file system in cui tutti i files dei programmi sono racchiusi in /Programs, e non sparsi in /usr/local/share/ - /usr/local/bin, o in /usr/share/ - /usr/bin mi pare più intuitivo...
così come il fatto che ci sia una directory che racchiude tutti i files di sistema, quindi la /var, le config /etc ...
non so, il file system odierno mi pare basato su una struttura vecchia, che non facilita di certo la vita all'utente ma confonde le idee, soprattutto ad un newbie che magari arriva da windows con tutte le buone intenzioni ma rinuncia perchè non capisce dove cacchio stanno i programmi installati, insomma