Il riferimento al file system FAT è l'opzione in più che offre il sw, tutti lavorano benissimo in NTFS
L'importante che il disco sia visto almeno nel bios e metti in preventivo, che ci possono volere diverse ore, sia per la lentezza del disco, che per il tempo che occorre al sw ad analizzare e poi a recuperare (nel caso fosse possibile).
Altro consiglio: se un sw fallisce, provarne un altro. A volte dove fallisce uno riesce l'altro.