Ciao, per esperienza personale e per i numerosi topic sull'argomento ti posso assicurare che non c'è nessun problema, gli SSD si formattano come i comunissimi (e per ora costosissimi

) HD meccanici, inserisci il cd dell'OS e segui la procedura tipica.
P.S: se hai più hd prova a tenere attivo solo quello che vuoi formattare, scollegando tutti gli altri.