Non è necessario eliminare le chiavi di registro inutilizzate perchè tanto vengono ignorate completamente dal sistema e non causano rallentamenti.
E' anche vero che in alcuni casi è necessario eliminare alcune chiavi di registro manualmente, ma non di certo i pulitori le individuano (la loro pulizia dopotutto è superficiale e inutile), quindi bisogna per forza farlo manualmente:
Start > regedit > Modifica > Trova > Trova successivo (F3)
Ma occhio a cosa si elimina perchè si possono fare danni gravi...questa è una operazione da fare solo in casi di estrema necessità