Come fai a fare uno stop motion con i flash?
I flash portatili non credo che reggano quella cadenza di scatto così prolungata... Se proprio devi illuminare direi che ti servono delle torce a luce continua da diffondere in softbox e all'occorrenza anche dei pannelli riflettenti.
Se lo stop motion dura parecchio e non vuoi avere problemi di illuminazione variabile l'unica soluzione è la luce artificiale. Altrimenti non vedo soluzioni...
Non so quanto ti paghino per questo lavoro, ma se non hai l'attrezzatura per l'illuminazione e devi affittarla/comprarla fai bene i tuoi conti.