Come poter utilizzare il secondo disco non posso certo dirtelo io...
Se avessi molti dati da immagazzinare, sapresti giā come utilizzarlo, ma evidentemente non li hai
Per il secondo sistema operativo, ci sono problemi se vuoi installare due W98 o ME, mentre con W98(o ME) e W2000 o XP, oppure anche con due W2000 o XP, basta procedere con l'installazione ed il cosiddetto Dual Boot avviene in automatico
Ti consiglio di leggere le discussioni in rilievo nella sezione Windows, dove ci sono tutte le spiegazioni del caso