Allora, non ne so moltissimo, ma cerco di spiegarti in parole povere....
La tecnologia SCSI è nata molto prima di quella EIDE e ha come vantaggio quello di poter collegare in cascata molte periferiche (non mi ricordo quante), e di occupare pochissimo la CPU.
Ci sono varie tipologie di SCSI, la più recente (che io sappia) è la Ultra 160 che permette appunto un transfer rate di 160Mb/s.
Altro vantaggio della SCSI è che attualmente, a differenza della EIDE, dispone di hard disks ad elevatissime velocità, ci sono alcuni modelli che raggiungono i 15000 giri!!

Gli Hard disks EIDE si sono fermati ai 7200 giri...
Vedremo che progressi ci saranno con la tecnologia Serial ATA...

Fino a un po' di tempo fa c'era un abisso tra SCSI ed EIDE, ma con il progresso tecnologico, piano piano stanno andando alla pari...
Il disco SCSI può essere messo in primario, dato che il controller SCSI fa un suo boot, basterà poi scegliere dal bios della scheda madre "boot da SCSI".
Tutti i controller, o quasi, sono buoni, l'unico mio consiglio è di acquistarne uno che sia di una casa ben conosciuta (ad esempio Adaptec), in modo tale da poter disporre sempre di un buon supporto con i drivers...
Spero di non averle sparate troppo grosse e di esserti stato utile...
Ciauz...