Tanto per dire la mia, ho l'impressione che le temp all'interno del tuo PC non sono l'optimum, a vedere quello che riporta HD Tune.
Per i primi due hd il problema sta più che altro nella voce C7 (Ultra DMA....),
che non nelle altre.
Significa un deterioramento della superfice magnetica del disco e le temp alte ne possono essere la causa.
Abbassale con una ventola posizionata davanti se possibile.
Per il 3° hd invece c'è un problema con alcuni settori, voce C5.
Usa il tool specifico del produttore per rimetterli a posto, o almeno per stabilire se sono correggibili o meno, oppure HDD Regenerator.
Qui una guida sul significato di tutte le voci SMART (wiki).