Se è usb non dovrebbero esserci problemi, se è e-sata non so, ma lo stesso dovrebbe andare
Quando lo formatti dipende da quali sistemi operativi vuoi usarlo: windows legge solo ntfs (o fat32, ma non è il massimo su un disco), Mac non so, linux li legge praticamente tutti... magari se vuoi usarlo *solo* per linux, usa ext3 o ext4, non ntfs